Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifnb1P01575 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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