Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms