Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

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Length 931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sema6cQ9WTM3 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms