Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
OtofQ9ESF1 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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