Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Smg9Q9DB90 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Smg9Q9DB90 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smg9Q9DB90 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms