Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Use1Q9CQ56 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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