Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Commd4Q9CQ02 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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