Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm10318-201ENSMUST00000186874 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5054-201ENSMUST00000119351 453 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm15798-201ENSMUST00000120082 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hecw1Q8K4P8 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms