Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms