Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp40Q8BWR4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Usp40Q8BWR4 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp40Q8BWR4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp40Q8BWR4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp40Q8BWR4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp40Q8BWR4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp40Q8BWR4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp40Q8BWR4 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp40Q8BWR4 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp40Q8BWR4 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp40Q8BWR4 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp40Q8BWR4 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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