Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp54Q8BL06 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp54Q8BL06 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm9260-201ENSMUST00000199781 1380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp54Q8BL06 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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