Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms