Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clcn1Q64347 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clcn1Q64347 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms