Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp48Q3V0C5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp48Q3V0C5 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp48Q3V0C5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp48Q3V0C5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp48Q3V0C5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp48Q3V0C5 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp48Q3V0C5 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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