Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc39dQ0VF76 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms