Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Pde1bQ01065 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Pde1bQ01065 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pde1bQ01065 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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