Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa8P50706 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms