Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms