Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC8.8□□□□□ -1
P18529 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC8.8□□□□□ -1
P18529 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC8.8□□□□□ -1
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P18529 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
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P18529 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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P18529 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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P18529 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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P18529 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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P18529 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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P18529 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
P18529 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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P18529 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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P18529 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
P18529 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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P18529 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
P18529 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC8.79□□□□□ -1
P18529 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
P18529 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC8.79□□□□□ -1
P18529 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
P18529 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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