Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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