Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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