Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3002E9PW72 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3002E9PW72 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms