Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm3550W4VSN7 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms