Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rabgef1Q9JM13 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms