Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Khdc3Q9CWU5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms