Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Krt23Q99PS0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Krt23Q99PS0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Krt23Q99PS0 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.3 ms