Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Usp16Q99LG0 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp16Q99LG0 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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