Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc187Q8C5V8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccdc187Q8C5V8 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccdc187Q8C5V8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc187Q8C5V8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc187Q8C5V8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc187Q8C5V8 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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