Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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