Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SnupnQ80W37 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms