Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pnma8aQ80VM8 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms