Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Dsg1bQ7TSF1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Dsg1bQ7TSF1 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Dsg1bQ7TSF1 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Dsg1bQ7TSF1 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Dsg1bQ7TSF1 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Dsg1bQ7TSF1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Dsg1bQ7TSF1 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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