Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Samhd1-201ENSMUST00000057725 3926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 AC108416.3-201ENSMUST00000226148 557 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Sptbn2Q68FG2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms