Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
BcanQ61361 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
BcanQ61361 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms