Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Q3U6N9 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Q3U6N9 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Q3U6N9 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Q3U6N9 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U6N9 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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