Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa8P50706 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa8P50706 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms