Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmod1P49813 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmod1P49813 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms