Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtpreP49446 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PtpreP49446 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtpreP49446 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms