Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
SrprbP47758 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms