Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd8P23463 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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