Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ggta1P23336 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms