Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
P18530 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
P18530 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms