Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms