Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fv4P11370 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms