Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01654 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01654 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01654 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01654 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01654 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01654 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01654 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01654 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01654 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01654 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01654 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms