Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttll2A4Q9E4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms