Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Lcn6A2AJB9 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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