Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms