Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pacsin3Q99JB8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms