Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Card11Q8CIS0 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms